W celu wdrożenia systemu zarz±dzania niezbędne jest także by Przedsiębiorstwo opracowało i wprowadzało system auditów wewnętrznych. Wdrożenie systemu auditów wewnętrznych wymaga:
opracowania procedury auditów wewnętrznych,
przeszkolenia auditorów wewnętrznych,
opracowania i realizacji programów auditów wewnętrznych oraz
dokonywania przegl±dów z auditów wewnętrznych i podejmowania na podstawie ich wyników działań koryguj±cych.
Formalnym potwierdzeniem zgodno¶ci wdrożonego systemu zarz±dzania jest certyfikacja dokonywana przez Jednostkę Niezależn± w drodze tzw. auditu trzeciej strony.